Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UFSP1Q6NVU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UFSP1Q6NVU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms