Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGALS9CQ6DKI2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LGALS9CQ6DKI2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGALS9CQ6DKI2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LGALS9CQ6DKI2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LGALS9CQ6DKI2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGALS9CQ6DKI2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LGALS9CQ6DKI2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms