Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEL1L3Q68CR1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEL1L3Q68CR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEL1L3Q68CR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEL1L3Q68CR1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms