Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXB2Q5VYV0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXB2Q5VYV0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXB2Q5VYV0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXB2Q5VYV0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXB2Q5VYV0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXB2Q5VYV0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXB2Q5VYV0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXB2Q5VYV0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms