Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SUSD4Q5VX71 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SUSD4Q5VX71 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SUSD4Q5VX71 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SUSD4Q5VX71 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms