Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUD1Q5VV17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUD1Q5VV17 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms