Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q5VSD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q5VSD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5VSD8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5VSD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q5VSD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q5VSD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q5VSD8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q5VSD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q5VSD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q5VSD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q5VSD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q5VSD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q5VSD8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q5VSD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q5VSD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q5VSD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q5VSD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q5VSD8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q5VSD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q5VSD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q5VSD8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q5VSD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q5VSD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q5VSD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q5VSD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
Q5VSD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms