Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM20Q5T481 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBM20Q5T481 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBM20Q5T481 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM20Q5T481 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM20Q5T481 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBM20Q5T481 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM20Q5T481 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM20Q5T481 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM20Q5T481 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBM20Q5T481 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms