Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNT1Q5JUK3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNT1Q5JUK3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNT1Q5JUK3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNT1Q5JUK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms