Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGD3Q5JSP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGD3Q5JSP0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD3Q5JSP0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms