Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGO1Q5FBB7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGO1Q5FBB7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO1Q5FBB7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO1Q5FBB7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO1Q5FBB7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO1Q5FBB7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO1Q5FBB7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGO1Q5FBB7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGO1Q5FBB7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms