Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1BQ53T94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1BQ53T94 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1BQ53T94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms