Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPAT3Q53EU6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAT3Q53EU6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPAT3Q53EU6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAT3Q53EU6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms