Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIS6

ZNF528, Zinc finger protein 528, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF528Q3MIS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF528Q3MIS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF528Q3MIS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF528Q3MIS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms