Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A8Q2Y0W8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A8Q2Y0W8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms