Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSPP1Q1MSJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CSPP1Q1MSJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms