Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IMPG1Q17R60 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IMPG1Q17R60 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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