Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGISQ16647 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTGISQ16647 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms