Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMN1Q16637 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMN1Q16637 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMN1Q16637 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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