Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGCAQ16586 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SGCAQ16586 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGCAQ16586 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCAQ16586 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCAQ16586 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCAQ16586 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCAQ16586 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCAQ16586 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGCAQ16586 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGCAQ16586 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGCAQ16586 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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