Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCBQ16585 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCBQ16585 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGCBQ16585 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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