Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
VPS72Q15906 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VPS72Q15906 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VPS72Q15906 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
VPS72Q15906 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
VPS72Q15906 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
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