Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD1Q15797 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD1Q15797 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD1Q15797 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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