Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB30Q15771 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB30Q15771 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB30Q15771 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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