Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A3R2Q15599 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A3R2Q15599 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A3R2Q15599 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A3R2Q15599 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A3R2Q15599 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A3R2Q15599 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A3R2Q15599 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC9A3R2Q15599 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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