Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGIF1Q15583 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGIF1Q15583 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGIF1Q15583 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGIF1Q15583 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms