Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIV2LQ15477 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIV2LQ15477 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIV2LQ15477 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIV2LQ15477 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms