Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN1Q15293 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms