Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCAPD2Q15021 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCAPD2Q15021 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NCAPD2Q15021 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCAPD2Q15021 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
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