Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
GAPVD1Q14C86 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.69■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.66■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GAPVD1Q14C86 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
GAPVD1Q14C86 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GAPVD1Q14C86 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
GAPVD1Q14C86 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
GAPVD1Q14C86 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
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