Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CNGB1Q14028 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CNGB1Q14028 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNGB1Q14028 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CNGB1Q14028 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
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