Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NEUROD1Q13562 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NEUROD1Q13562 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NEUROD1Q13562 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NEUROD1Q13562 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
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