Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRQ13535 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRQ13535 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRQ13535 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRQ13535 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATRQ13535 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATRQ13535 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRQ13535 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRQ13535 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRQ13535 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATRQ13535 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRQ13535 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRQ13535 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRQ13535 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRQ13535 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRQ13535 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRQ13535 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATRQ13535 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRQ13535 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRQ13535 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRQ13535 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRQ13535 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRQ13535 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRQ13535 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATRQ13535 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRQ13535 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRQ13535 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRQ13535 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATRQ13535 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRQ13535 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRQ13535 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRQ13535 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATRQ13535 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRQ13535 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRQ13535 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRQ13535 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRQ13535 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATRQ13535 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATRQ13535 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRQ13535 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRQ13535 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRQ13535 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATRQ13535 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRQ13535 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ATRQ13535 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRQ13535 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATRQ13535 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATRQ13535 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATRQ13535 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATRQ13535 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATRQ13535 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRQ13535 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRQ13535 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRQ13535 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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