Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PICALMQ13492 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PICALMQ13492 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PICALMQ13492 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PICALMQ13492 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PICALMQ13492 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PICALMQ13492 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PICALMQ13492 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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