Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSAMPQ13449 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSAMPQ13449 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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