Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA4Q13439 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA4Q13439 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA4Q13439 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA4Q13439 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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