Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRSQ13332 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRSQ13332 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRSQ13332 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRSQ13332 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRSQ13332 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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