Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RESTQ13127 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RESTQ13127 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RESTQ13127 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RESTQ13127 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RESTQ13127 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RESTQ13127 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RESTQ13127 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RESTQ13127 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RESTQ13127 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RESTQ13127 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RESTQ13127 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RESTQ13127 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RESTQ13127 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RESTQ13127 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RESTQ13127 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RESTQ13127 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RESTQ13127 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RESTQ13127 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RESTQ13127 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RESTQ13127 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RESTQ13127 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RESTQ13127 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RESTQ13127 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RESTQ13127 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RESTQ13127 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RESTQ13127 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RESTQ13127 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RESTQ13127 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RESTQ13127 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RESTQ13127 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RESTQ13127 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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RESTQ13127 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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RESTQ13127 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RESTQ13127 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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RESTQ13127 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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RESTQ13127 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RESTQ13127 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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RESTQ13127 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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RESTQ13127 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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RESTQ13127 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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RESTQ13127 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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RESTQ13127 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RESTQ13127 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RESTQ13127 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RESTQ13127 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RESTQ13127 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RESTQ13127 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RESTQ13127 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RESTQ13127 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RESTQ13127 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RESTQ13127 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RESTQ13127 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RESTQ13127 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RESTQ13127 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RESTQ13127 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RESTQ13127 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RESTQ13127 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RESTQ13127 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RESTQ13127 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RESTQ13127 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RESTQ13127 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
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