Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MKRN3Q13064 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MKRN3Q13064 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MKRN3Q13064 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKRN3Q13064 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
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