Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC16Q13042 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC16Q13042 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC16Q13042 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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