Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF3Q12996 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSTF3Q12996 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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