Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C1Q12789 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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