Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4DQ08499 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PDE4DQ08499 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE4DQ08499 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE4DQ08499 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms