Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGM3Q08188 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGM3Q08188 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGM3Q08188 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGM3Q08188 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms