Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNK2Q07912 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNK2Q07912 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNK2Q07912 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms