Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN1Q05586 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN1Q05586 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN1Q05586 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN1Q05586 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms