Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ERCC6Q03468 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ERCC6Q03468 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC42.63■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ERCC6Q03468 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ERCC6Q03468 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
ERCC6Q03468 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ERCC6Q03468 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms