Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPCQ03188 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPCQ03188 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPCQ03188 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPCQ03188 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPCQ03188 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPCQ03188 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPCQ03188 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPCQ03188 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPCQ03188 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms