Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFAIP2Q03169 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNFAIP2Q03169 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNFAIP2Q03169 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms