Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 525.66■■□□□ 1.76e-9■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-208ENST00000572010 1016 ntTSL 1 (best)28.1■■■□□ 2.098e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-217ENST00000576462 673 ntTSL 226.37■■□□□ 1.818e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.218e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-212ENST00000573023 3649 ntTSL 522.41■■□□□ 1.188e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.038e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-207ENST00000571299 891 ntTSL 321.25■□□□□ 0.998e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-216ENST00000576377 868 ntTSL 520.72■□□□□ 0.918e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.178e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-219ENST00000576616 3768 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.268e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 SLC12A4-206ENST00000570802 3761 ntTSL 212.92□□□□□ -0.348e-6■■■□□ 17.9
FKBP4Q02790 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.293e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 419.21■□□□□ 0.671e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 415.52■□□□□ 0.081e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 413.05□□□□□ -0.321e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.53e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.463e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.273e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.753e-6■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 227.24■■□□□ 1.952e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-206ENST00000460762 459 ntTSL 226.3■■□□□ 1.82e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)24.59■■□□□ 1.538e-7■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.42e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-209ENST00000512283 567 ntTSL 423.74■■□□□ 1.392e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.192e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 222.42■■□□□ 1.182e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.012e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 219.95■□□□□ 0.788e-7■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 415.75■□□□□ 0.112e-11■■■□□ 17.7
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 583 ntTSL 221.45■■□□□ 1.027e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-208ENST00000498199 511 ntTSL 221.29■■□□□ 17e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-213ENST00000520629 415 ntTSL 321.03■□□□□ 0.967e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-220ENST00000524210 2591 ntTSL 519.1■□□□□ 0.657e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.187e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 UCKL1-205ENST00000483710 524 ntTSL 313.15□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 LINC-PINT-202ENST00000423414 616 ntTSL 429.28■■■□□ 2.283e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 SPIRE2-209ENST00000566337 1369 ntTSL 529.01■■■□□ 2.233e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 LINC-PINT-204ENST00000431189 803 ntTSL 328.47■■■□□ 2.153e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.13e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.033e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 LINC-PINT-203ENST00000429901 565 ntTSL 426.26■■□□□ 1.793e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.743e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.663e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-209ENST00000549030 1925 ntTSL 225.01■■□□□ 1.593e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 SPIRE2-206ENST00000564878 663 ntTSL 323.27■■□□□ 1.323e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 LINC-PINT-205ENST00000433079 1262 ntTSL 1 (best)22.77■■□□□ 1.243e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-206ENST00000547903 1157 ntTSL 522.69■■□□□ 1.223e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.23e-10■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.093e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.013e-10■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.963e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.943e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.853e-10■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.833e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-212ENST00000551743 1876 ntTSL 520.22■□□□□ 0.833e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.783e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.63e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 316.54■□□□□ 0.243e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 PACS2-211ENST00000551692 3453 ntTSL 215.79■□□□□ 0.123e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 BMP4-202ENST00000417573 1784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.093e-6■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.43e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 CAPRIN2-206ENST00000534897 478 ntTSL 45.31□□□□□ -1.563e-7■■■□□ 17.6
FKBP4Q02790 ERF-203ENST00000593944 555 ntTSL 424.33■■□□□ 1.491e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 ERF-205ENST00000595941 227 ntTSL 49.99□□□□□ -0.811e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 527.68■■■□□ 2.021e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 227.37■■□□□ 1.971e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.711e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 525.52■■□□□ 1.681e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.621e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 324.69■■□□□ 1.541e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-215ENST00000518736 883 ntTSL 324.28■■□□□ 1.481e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.271e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-212ENST00000480304 2247 ntTSL 211.91□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.531e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.571e-6■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 211.06□□□□□ -0.647e-8■■■□□ 17.5
FKBP4Q02790 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.225e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.135e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.655e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-213ENST00000600105 635 ntTSL 325.35■■□□□ 1.655e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-203ENST00000594165 986 ntTSL 324.09■■□□□ 1.455e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.745e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 518.76■□□□□ 0.595e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-202ENST00000594151 995 ntTSL 518.52■□□□□ 0.565e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.545e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 216.86■□□□□ 0.295e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 PTOV1-215ENST00000600793 426 ntTSL 516.25■□□□□ 0.195e-8■■■□□ 17.4
FKBP4Q02790 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.455e-7■■■□□ 17.3
FKBP4Q02790 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.25e-7■■■□□ 17.3
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 61.9 ms